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虐待部属罪立案标准是：行为人虐待部属，虐待手段残酷的；虐待三人以上的；虐待部属三次以上的；虐待伤病残部属的；部属不堪忍受虐待而自杀、自残造成重伤或者精神失常的；诱发其他案件、事故的；导致部属一人逃离部队三次以上，或者二人以上逃离部队的；造成恶劣影响的，应予立案追诉。

《军人违反职责罪案件立案标准的规定》第二十六条